개요 자바에 대한 함수 인자 전달 방식에 대한 얘기를 나누다가 파이썬에서는 함수에 인자를 어떻게 전달 받을까? 라는 의문으로 글을 작성하게 되었다. 결론 먼저 말하자면 역시 파이썬은 특이하다. 함수 인자 전달 방식 함수 인자 전달방식은 각각의 프로그래밍 언어마다 다른 방식을 사용하지만 비슷한 형태를 띄는데 일반적으로 사용되는 함수인자 전달 방식은 call-by-value (값에 의한 호출)와 call-by-reference (참조에 의한 호출)가 있다. 하지만 파이썬은 일반적으로 많이 사용되는 언어인 C언어와 JAVA와 다르게 함수 인자를 Call by assignment 형식으로 전달하기에 이를 알아보려고 한다. call-by-value (값에 의한 호출) 함수에서 값을 복사해서 전달해주는 방식으로, ..
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개요 대학선배들과 술을 먹다가 도커에 관한 이야기가 나왔는데 "도커와 VM의 실질적인 차이가 멀까?"라는 것에 대해 정확히 알지 못해 정리를 해보려고 한다. 정확히는 Contanier vs hypervisor가 맞는 것 같다. Virtual Machine이란? VM(virtual machine)의 정의는 컴퓨팅 환경을 소프트웨어로 구현한 것, 즉 컴퓨터 시스템을 에뮬레이션(가상현실화)하는 소프트웨어라고 하며, 가상머신상에서 운영 체제나 응용 프로그램을 설치 및 실행할 수 있다고 한다. VM에 대해서 찾아보면 하이퍼 바이저 기술이 등장한다. 하이퍼바이저(hypervisor)? 하이퍼바이저(hypervisor)는 호스트 컴퓨터에서 다수의 운영 체제(operating system)를 동시에 실행하기 위한 논리..
개요 소프트웨어 의료기기의 신뢰도 검사를 하던 중 Bland-Altman Plot에 대해 알게되어 자료를 조사하다가 논문을 찾아보게 되어 내용에 대한 정리와 해당 지표들을 Python으로 표현하는 방법에 대해 간단히 정리한다. 오늘 작성하게 될 글은 각각의 평가지표에 대한 내용의 초점 보다는 Python으로 표현하는 방법에 대해 초점을 둔다. 서론 임상이나 의학에 대한 연구에서 질병 진단 또는 환자의 예후 추정을 위해 적절한 측정법 또는 검사법을 통해 임상적 결정을 내리는 과정을 거친다. 검사법은 정확도(타당도)와 신뢰도(일관성, 반복성, 재현성, 일치도) 에 측면에 있어 평가를 진행한다. 이때 신뢰도를 측정하는데 사용되는 지표들이 Bland-Altman Plot, ICC가 존재한다. 본론 1) 급내상관..
메디컬 데이터에서 많이 사용되는 CV 기법인 segmentation에 대한 논문 리뷰를 진행해 보겠습니다. segmentation은 딥러닝에서도 많이 다루고 있는 주제 중에 하나이지만 딥러닝 같은경우 가용되는 컴퓨터 리소스도 많을 뿐더러 많은 데이터가 필요하다는 단점이 있습니다 메디컬 데이터 측면에서 본다면 일반적인 데이터보다 라벨링이 어렵다는게 가장 큰 문제인데 메디컬 데이터는 일반적인 사람이 라베링하기가 많이 어렵기 때문에 의료인(관련 분야의 의사, 영상의학과 교수 등등)이 진행해야 합니다. 하지만 의료인과 같은 경우는 전문적인 직종일 뿐더러 인적자원이 풍부하지 않기 때문에 더더욱 어렵다는 점이 있습니다. 따라서 오늘은 보다 전통적인 방법인 Otsu을 사용하여 segmentation을 진행하는 논문에..
지난 글에는 DICOM의 역사 및 필요성, 확장자에 대한 이해를 주로 다루 었습니다. 이번 글에는 DICOM을 Python으로 불러들이는 방법 및 유용한 라이브러리들을 소개해드리겠습니다. Medical Image 도 다양한 도메인들이 존재합니다. 지난 글에도 말씀드렸다시피 여러 가지의 도메인이나 촬영기법(Sequence)의 이미지를 하나의 확장자로 묶어 사용을 용이하게 하기 위해 DICOM이 나타나게 되었다고 말씀드렸습니다. 제가 주로 사용하는 이미지는 자기공명혈관 조영술(Magnetic resonance angiography, MRA)이라는 Sequence 중 3D TOF (time-of-flight) MRA로 촬영된 이미지를 사용하고 있습니다. 해당 촬영기법에 대해서는 추후에 다루어 보도록 하고, 이..
